Lumenjtë e Taxhikistanit janë të rrjedhshëm dhe kryesisht i përkasin pellgut të Detit Aral. Dhe vetëm disa derdhen në ujërat e liqenit Karakul ose lumit Tarima.
Lumi Amu Darya
Kanali i Amu Darya kalon në territorin e katër vendeve menjëherë - Afganistan, Taxhikistan, Uzbekistan dhe Turkmenistan. Gjatësia e përgjithshme e kanalit është 2.400 kilometra. Nga këto, 1,415 kilometra kalojnë nëpër vend. Burimi i Amu Darya është formuar nga bashkimi i dy lumenjve - Vakhsh dhe Pyanj. Gryka e lumit është ujërat e Detit Aral (në bashkimin ai formon një deltë të madhe).
Ka pak degë pranë lumit. Mesatarisht, Amu Darya merr ujërat e Kafirnigan, Surkhandarya dhe Sherebad, si dhe një degë të majtë - lumi Kunduz. Dhe më tej, deri në vendin e bashkimit, nuk ka më degë. Ujërat e lumit përdoren në mënyrë aktive, dhe për këtë arsye Amu Darya nuk arrin në Detin Aral. Kjo është pikërisht ajo që u bë një nga arsyet e tharjes së saj.
Në ujërat e Amu Darya, ka mjaft varietete të ndryshme peshqish: asp; njeri tullac; mustak aral; krapi; peshk sabre; krap argjendi; Amur i bardhë; urrejtje
Lumi Vanj
Një nga lumenjtë, kanali i të cilit ndodhet ekskluzivisht në territorin e Taxhikistanit. Shtë një degë e drejtë e lumit Pyanj. Gjatësia e përgjithshme e lumit është 103 kilometra. Burimi formohet nga bashkimi i dy lumenjve - njëri zbret nga akullnajat e kreshtës Vanch, tjetri nga kreshta e Akademisë së Shkencave (shpati perëndimor). Kanali kalon midis kreshtave Vanch dhe Darvaz.
Lumi Kashkadarya
Territorialisht, shtrati i lumit kalon nëpër tokat e Taxhikistanit (rajoni Sughd) dhe Uzbekistanit (rajoni Kashkadarya). Në mënyrë konvencionale, lumi ka tre emra: në rrjedhën e sipërme - Obikhunda; kursi i mesëm - Shinachasai; më e ulët - Maimanakadarya.
Gjatësia e përgjithshme e kanalit është 378 kilometra. Burimi i lumit është në një lartësi prej 2960 metra mbi nivelin e detit dhe formohet nga dy lumenj pa emër. Degët kryesore: Akdarya (Aksu); Tanhidizadarya; Guzardarya.
Lumi Muksu
Gjatësia e përgjithshme e kanalit është 88 kilometra. Muksu ndodhet në rajonin Jirgatal të Taxhikistanit. Burimi është bashkimi i dy lumenjve: Seldara dhe Sauksoy (akullnajat Fedchenko dhe Bolshoi Saukdar).
Lumi Kuzylsu
Kyzylsu, që do të thotë "lumi i kuq", rrjedh nëpër territorin e Kirgistanit dhe Taxhikistanit. Burimi janë shpatet e Vargmalit Trans-Alai. Gjatësia e përgjithshme e kanalit është 235 kilometra. Në bashkimin me lumin Muksu, ai lind lumin Vakhsh.
Lumi Vakhsh
Gjatësia e përgjithshme e kanalit të lumit është 786 kilometra, dhe të gjithë kalojnë nëpër territorin e Taxhikistanit. Burimi i lumit është në shpatet e Pamirit, por vendi i bashkimit të tij me ujërat e lumit Pyanj lind lindjen e madhe Amu Darya. Lumi është burimi kryesor për ujitje si dhe prodhimin e energjisë.